新疆醫科大學圖書館前身是始建于1956年的原新疆醫學院圖書館，經過合并改建，目前面積達15000多平方米。作為現代化圖書館，它不僅是該校的文獻信息中心，更是新疆地區醫學知識的重要匯聚地。圖書館擁有豐富的紙質圖書和電子資源，訂閱專業期刊、社科類期刊近1400多種，訂閱各類報紙60種，現有電子圖書12萬種，為師生提供了優越的學習和研究環境。