環境生態工程主要研究環境學、生態學等方面的基本知識和技能，通過運用生態學的原理、工程學的手段來進行污染防治和環境保護等。例如：水土流失、土地荒漠化等生態環境問題的治理，大氣、水體、土壤等生態污染的防治，生態園林的規劃設計等。