牡丹江醫學院第二附屬醫院位于牡丹江市曉云街3號，是一所集醫療、教學、科研、預防保健于一體的三級甲等醫院，也是牡丹江唯一一家美國唇腭裂微笑列車合作醫院，世界眼科組織黑龍江省牡丹江市李兆基眼科中心就設置在醫學院附屬二院。醫院占地面積33405平方米，建筑面積69489.69平方米，床位編制數800張，下設30個臨床科室，13個醫技科室，一個門診部和4 個社區衛生服務中心。院內擁有大量優秀人才、先進配套的醫療設備和現代化的就醫環境，能夠為患者提供高水平的治療條件。