海軍建立了一所綜合性三級甲等醫院——海軍軍醫大學長征醫院。醫院前身名字多次變化，從德國寶隆醫院到國立同濟大學附屬醫院，再到中美醫院，最后定名為海軍軍醫大學長征醫院。醫院設有47個業務科室、35個臨床科室和12個輔診科室，擁有20個臨床教研室，有28個博士授權學科和33個碩士授權學科，同時也是臨床博士后流動站。醫院擁有10個國家重點學科，4個全軍醫學研究所，6個全軍醫學專科技術中心，2個上海市醫學領先專業重點學科和2個上海市臨床醫學中心。醫院技術力量強大，擁有244名高級職稱專業技術人員，包括1名中國工程院院士和3名國家杰青等。醫院還有40多名獲得國家和上海市的各類人才計劃的專家。此外，醫院的技術人員還擔任了505個國際和國內學術組織的重要職務。