西藏軍區總醫院前身為陸軍第49醫院，擁有博士后科研工作站、博士培養點等，設有44個臨床醫技科室。醫院床位1370張，年門診量近14萬余人次，住院人次2.2萬余人次。此外，醫院擁有PET-CT、核磁共振等大型醫療設備，曾兩次被評為全國民族團結進步模范單位。2010年8月，醫院被中央軍委記集體二等功，醫院赴玉樹抗震救災醫療隊被國務院、中央軍委授予“抗震救災英雄集體”稱號。