蚌埠高新實驗學校是2000年，在原蚌埠第三實驗小學基礎上成立蚌埠實驗學校中學部，后在2010年更名為現在的名字。短短十多年間，“青藍工程”結出碩果、“青年教師成長計劃”穩步推進，一批批骨干教師脫穎而出。現今該校已經有著全國信息技術與道德示范校、全國學習科學實驗學校等榮譽。