福州三中座落于榕城風景秀麗的西湖之濱，創辦于1942年，前身是“福州市立初級中學”，1952年6月，經福州市統一調整校名，學校被正式定名為“福州第三中學”，從此校名沿用。1953年，學校被確定福州市重點中學，1963年它被確定為首批14所省級重點校之一， 1994年學校被確定為省一級達標校，1995年和2005年兩次被推舉為中國知名中學科研聯合體的常務副理事長單位。