招商局南京油運股份有限公司主要從事燃供及化學品貿易業務、內外貿油品、化學品和氣體運輸業務。原油運輸方面,公司主要從事國內沿海原油運輸并輔以少量外貿運輸。其中,內貿原油運輸主要包括渤海灣地區、海進江以及長江口、寧波舟山地區等三大區域;外貿原油運輸主要包括東南亞、東北亞和澳洲航線。成品油運輸方面,公司主要從事外貿運輸,主要營運區域包括東北亞、新加坡和澳洲以及中東和東非等;此外公司外貿成品油業務還有少量涉足美國、地中海和波羅的海等區域。化工品及氣體運輸經營區域為國內沿海、遠東和東南亞航線。