納特龍湖位于東非大裂谷東部，湖泊由于部分斷層塌陷形成。湖水里有著各種各樣的礦物質，在湖泊旁邊還有一座被稱為蓋拉伊火山的活火山。火山噴發將大量含有碳酸鈉的巖漿侵入湖水，同時根據降雨量的不同湖泊的水位也會發生一定的變化，造成湖水的ph值在9到10之間浮動，其堿度與氨差不多。