賽菊巴寺位于薩迦縣駐地東邊的賽·藏節曲河北岸，寺廟坐落在大日山南麓的山坳里，被三面環山所包圍，距離帕度村800米。始建于15世紀中葉，由宗喀巴大師的得意弟子吉·喜饒僧格建造。寺廟占地面積12000平方米，包括大殿、甘丹頗章、僧舍等建筑。賽菊巴寺是格魯派密宗寺院的開端，被賦予了修行密法的重要使命。寺廟環境幽雅，遠離人煙，適合潛心修行。現如今，賽菊巴寺每三年由拉薩下密院派遣赤巴管理。