漫威蜘蛛俠2扮演蜘蛛俠維護和平，狂暴沙人的突然出現打破了紐約的和平，獵人克雷文率領的團隊被襲擊后帶走，讓整個城市陷入一片的混亂，另外兩位蜘蛛俠將繼續守護這座城市跟超級大反派展開激烈的戰斗，每位蜘蛛俠最高等級為60級，通過點數來提升自己的技能，兩個角色的戰衣和經驗值是共享的。