庫都爾鎮是1958年3月經呼倫貝爾盟批準建鎮，因庫都爾河流貫穿全鎮依河命名。

庫都爾鎮位于牙克石市境東北部，東經120°53′­——121°59′，北緯49°36′——50°16′，東連鄂倫春自治旗，西至陳巴爾虎旗，南接烏爾其漢鎮和牧原鎮，北抵圖里鎮，鎮政府位于牙林鐵路143公里處，鎮處大興嶺主脈搏中段高地。

2001年因國家實施鄉鎮機構改革撤鄉并鎮，將原林鎮、新帳房鎮合并為庫都爾鎮，合并后的庫都爾鎮區行政區域總面積為3163.8平方公里，占全市面積的11.5%，其中行政區內林地面積250950.4公頃，草場16533.2公頃，耕地2533.3公頃，水域面積439.1公頃，建設用地2939.5公頃，荒草地13173公頃。

庫都爾鎮下轄2個管委會，6個社區居委會，居住著漢、蒙、回、滿、朝鮮、達翰爾、鄂倫春等15個民族，總人口36089人，總戶數13236戶，其中少數民族人口為2245人，占全鎮人口的7.3%。鎮內駐在企業有林業企業、鐵路、供電、金融、保險、郵電等，群眾文化生活豐富，醫療衛生、商業服務等設施齊全，交通便利，林業有內蒙古大興安嶺林管局庫都爾森林工業有限公司，庫森公司可以進行森林采伐、營林、綜合加工、木材生產和第三產業發展等項目，鐵路有車站及各工段等單位，供電有大興安嶺根河電業局庫都爾供電所。

處在大興安嶺主脈搏中段高的庫都爾鎮，有著得天獨厚的自然資源，物產豐富，其中地上資源有以落葉松、白樺、山楊為主的430741公頃森林資源，和黃芪、黃岑、芍藥、沙參、柴胡、藿香等為主的野生名貴中草藥，遍地的野生漿果比比皆是，有東方草莓、山蔥、蕨菜、越桔、水葡萄、榮蘭靛果、忍冬等山野果菜，有猴頭、木耳、白蘑、花臉蘑等食用真菌，豐富的草場養育了成群的牛羊，地下蘊藏著鉛鋅鉬等礦產資源，其開發前景、利用價值、經濟優勢相當廣闊。

建鎮46年來，鎮委、鎮政府帶領全鎮人民艱苦奮斗，努力拼搏，改變了過去全鎮經濟以林業為主的滯后局面，圍繞資源優勢，因地至宜，在農牧業上大做文章，目前全鎮共有耕地38000畝，生產小麥、油菜、馬鈴薯、白菜、胡蘿卜等，11個家庭家場調整了種植結構，形成了“為牧而農，為工而牧，為農牧而工”的產業格局。.

2010年3月，環境保護部授予庫都爾鎮2010年國家生態建設示范區之“全國環境優美鄉鎮”稱號。